Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCF2P10911 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCF2P10911 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCF2P10911 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms