Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms