Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms