Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGF1P05230 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGF1P05230 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGF1P05230 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGF1P05230 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGF1P05230 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGF1P05230 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGF1P05230 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGF1P05230 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FGF1P05230 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGF1P05230 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms