Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms