Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL5O76039 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms