Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9AO75110 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms