Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A2O14975 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms