Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEURL1BA8MQ27 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms