Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM4A7MD48 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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