Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms