Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WWV3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms