Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC004862.1-209ENST00000437763 1678 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SAXO1-203ENST00000542071 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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