Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SCGB2A2-201ENST00000227918 505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PSMD10-205ENST00000372295 779 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CST9LP1-201ENST00000376987 444 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-IT1-201ENST00000423329 804 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 METTL8P1-201ENST00000428182 611 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL445189.2-201ENST00000447543 259 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3P2-201ENST00000480063 232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CASC16-201ENST00000510238 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-206ENST00000512129 430 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC010834.2-201ENST00000523945 530 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP002892.2-201ENST00000544195 560 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NBPF5P-202ENST00000545941 1032 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SSX2B-204ENST00000616191 1344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ASAP1-IT2-201ENST00000626977 2031 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FCAR-207ENST00000391725 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP168-201ENST00000410910 300 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL36P2-201ENST00000426026 315 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL138881.1-201ENST00000443445 789 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00894-207ENST00000452864 750 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms