Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms