Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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