Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL929601.3-201ENST00000613990 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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