Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2Q9Y4W6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms