Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms