Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHIC2Q9UKJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms