Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms