Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms