Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms