Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms