Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms