Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms