Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ASCL3Q9NQ33 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms