Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms