Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LARP6Q9BRS8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms