Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSG101Q99816 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSG101Q99816 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms