Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 SSS1YDR086C 243 nt1.2□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YDR344CYDR344C 444 nt1.2□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 NHP2YDL208W 471 nt1.19□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YFL032WYFL032W 321 nt1.19□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YOL014WYOL014W 375 nt1.19□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 APL1YJR005W 2103 nt1.19□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YDR413CYDR413C 576 nt1.18□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 RPS25BYLR333C 327 nt1.18□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 STE5YDR103W 2754 nt1.18□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.17□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 DBP6YNR038W 1890 nt1.16□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YGL149WYGL149W 306 nt1.16□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 SPO21YOL091W 1830 nt1.15□□□□□ -2.22
YLL066CQ99208 YBR064WYBR064W 429 nt1.14□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 COG8YML071C 1824 nt1.13□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 YIL032CYIL032C 357 nt1.12□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 ALG13YGL047W 609 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 BPH1YCR032W 6504 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 WAR1YML076C 2835 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 YSP1YHR155W 3687 nt1.11□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 RPS27BYHR021C 249 nt1.09□□□□□ -2.23
YLL066CQ99208 FMP27YLR454W 7887 nt1.09□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 ISD11YER048W-A 285 nt1.08□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YNL146WYNL146W 303 nt1.08□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.08□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 VIK1YPL253C 1944 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 snR60snR60 104 nt1.06□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 NOP9YJL010C 2001 nt1.05□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 CSE2YNR010W 450 nt1.05□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 ASE1YOR058C 2658 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 OLI1Q0130 231 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YNL028WYNL028W 318 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YOR282WYOR282W 321 nt1.04□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 snR65snR65 100 nt1.03□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 CMC4YMR194C-B 222 nt1.03□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YOR218CYOR218C 420 nt1.03□□□□□ -2.24
YLL066CQ99208 YDL196WYDL196W 330 nt1.02□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 IES4YOR189W 351 nt1.02□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 BUL2YML111W 2763 nt1.01□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 PAA1YDR071C 576 nt1.01□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 MCM10YIL150C 1716 nt1.01□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 BUD3YCL014W 4911 nt0.99□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.98□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.97□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YNL211CYNL211C 261 nt0.97□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.97□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 YPL044CYPL044C 549 nt0.97□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 HAL9YOL089C 3093 nt0.97□□□□□ -2.25
YLL066CQ99208 PMP1YCR024C-A 123 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 RAD61YDR014W 1944 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 ECM12YHR021W-A 456 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 SGF11YPL047W 300 nt0.96□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.95□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YOR015WYOR015W 360 nt0.95□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.95□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 AI1Q0050 2505 nt0.94□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 UTP8YGR128C 2142 nt0.94□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.93□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 RPL26BYGR034W 384 nt0.93□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 BFR2YDR299W 1605 nt0.92□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.92□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YGR069WYGR069W 336 nt0.91□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.91□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 TRS65YGR166W 1683 nt0.9□□□□□ -2.26
YLL066CQ99208 SEC8YPR055W 3198 nt0.9□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 BEM3YPL115C 3387 nt0.89□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YGL052WYGL052W 306 nt0.88□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 SEC1YDR164C 2175 nt0.88□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.87□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YJL113WYJL113W 4647 nt0.87□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.86□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YPR092WYPR092W 306 nt0.86□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.84□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.84□□□□□ -2.27
YLL066CQ99208 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.83□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 snR190snR190 190 nt0.83□□□□□ -2.28
YLL066CQ99208 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.8 ms