Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms