Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms