Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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