Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms