Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALML4Q96GE6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms