Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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GTF3C6Q969F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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GTF3C6Q969F1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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GTF3C6Q969F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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