Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAAF4Q8WXU2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms