Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF31Q8WWY3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms