Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRSK1Q8TDC3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms