Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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