Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms