Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms