Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC84Q86UT8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms