Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3BQ7Z3V4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms