Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms