Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO4C1Q6ZQN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms