Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms