Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms