Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL6IP4Q66PJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms